Proposition de Maîtrise en écologie moléculaire
Publié le 15 novembre 2024Utiliser l’ADN des repas d’invertébrés (ADNi) pour inventorier la faune vertébrée
Les résultats de plusieurs études en milieu tropical suggèrent que le séquençage de l’ADN contenu dans le système digestif des invertébrés (ADNi) permet d’obtenir une liste des vertébrés occupant une région donnée. Cependant, cette approche n’a jamais été testée dans des régions tempérées ou froides, où la biomasse et la diversité des vertébrés est plus faible. En outre, la relation entre la biodiversité échantillonnée par l’ADNi et la biodiversité réelle d’une région n’a été que peu explorée. L’étudiant.e à la maitrise réalisera un projet de recherche portant sur l’utilisation de l’ADNi pour inventorier les vertébrés des forêts tempérées canadiennes. Le projet vise à (1) échantillonner selon des méthodes traditionnelles la diversité de certains vertébrés (grands et petits mammifères, oiseaux, anoures) d’une zone géographique restreinte et (2) la comparer aux données d’ADNi obtenues à partir d’invertébrés échantillonnés de manière concomitante. Le travail de terrain se déroulera dans les forêts autour du Mont Kaiikop, dans les Laurentides (QC). Ce projet de maîtrise est mené en partenariat avec la Coalition Conservation Mont Kaaikop et l’organisation MITACS. Les résultats de cette maîtrise permettront d’évaluer la robustesse de cette approche novatrice dans le contexte étudié, ainsi que sa faisabilité à plus large échelle géographique. Pour plus de détails sur le projet, voir la vidéo de la Coalition Conservation Mont Kaaikop : https://www.youtube.com/watch?v=j00Q5q0Ubd4
L’étudiant.e sera amené.e à :
- Inventorier la biodiversité des vertébrés présents au Mont Kaiikop à l’aide de pièges photographiques et d’enregistreurs audio.
- Échantillonner les invertébrés volants hématophages et/ou carnivores présents au Mont Kaiikop à l’aide de pièges passifs.
- Extraire et séquencer l’ADNi des échantillons collectés
Comparer les résultats issus des techniques traditionnelles et du séquençage d’ADNi
L’étudiant.e interagira avec tous les membres du laboratoire de génomique écologique et environnementale de l’ISFORT [Institut des sciences de la forêt tempérée (Ripon, QC), rattaché à l’Université du Québec en Outaouais (Gatineau, QC)], qui comprend plusieurs étudiant.e.s à la maitrise et au doctorat, ainsi qu’un stagiaire postdoctoral et une technicienne. L’étudiant.e apprendra à utiliser un ensemble de technique d’échantillonnage et de suivi de la biodiversité, et acquerra des compétences en traitement, gestion et analyse des données. En outre, l’étudiant.e utilisera des techniques de biologie moléculaire de pointe. L’étudiant.e devra faire une demande d’admission à la maîtrise en Biologie de l’UQO : https://etudier.uqo.ca/programmes/3440
Conditions
- Financement MITACS prévu pour deux ans
- Débute en été ou automne 2025
- Si début automne 2025, possibilité d’emploi comme assistant.e de recherche pendant l’été
- Bourse d’étude de 24 k$/an pour deux ans Permis de conduire valide requis
Lieu de formation
- Collecte des données de terrain : Mont Kaaikop (Lantier, QC). L’hébergement sur le terrain sera couvert par le laboratoire
- Laboratoire et analyse des données : ISFORT, Ripon
Les personnes intéressées sont invitées à soumettre leur application (CV, relevé de notes non officiel) à Yann Surget-Groba (yann.surget-groba@uqo.ca) d’ici le 13 décembre 2024.
